Стационарная реабилитационная группа рассчитана только на юношей, предполагает круглосуточное проживание в малых группах (5 – 7 человек). Курс реабилитации рассчитан на период от 9 месяцев и может быть продлён до трёх лет, исходя из конкретной ситуации подростка. Реабилитационный курс состоит из четырёх этапов. Подросток переводится на очередной этап при условии успешного прохождения предыдущего.
Первый этап «Карантин», цель которого создать условия для погружения в развивающую среду. На этапе карантина воспитанник не может покидать Центр без сопровождения сотрудника. Проводится социальная и психологическая диагностика, составляется план индивидуального сопровождения. Минимальная продолжительность этого этапа 1 месяц.
Второй этап «Основной курс». Минимальная продолжительность - 3 месяца. Подросток может самостоятельно, без сопровождения сотрудников Центра, посещать учебные заведения и другие запланированные мероприятия. На каждую неделю составляется индивидуальное расписание, куда обязательно включены консультации психолога, психологические тренинги, занятия в творческих мастерских, занятия с волонтерами, выполняющими репетиторские функции, спортивные тренировки и другие мероприятия.
Третий этап «Индивидуальная программа» Для перевода на этот этап необходима положительная динамика в поведении, успехи в учёбе, проявление ответственности и инициативности при участии в мероприятиях. На этом этапе воспитаннику предоставляется поощрительный досуг, допустима замена, в соответствии с интересами воспитанника, некоторых мероприятий Центра, возможно в дневное время посещение дома. Минимальная длительность этапа – 3 месяца.
На четвёртый этап «Возвращение домой» воспитанник может быть переведён только при успешном прохождении всех предыдущих. Необходима устойчивая положительная динамика в поведении, постановка чётких перспективных целей и конкретных шагов для их реализации. На этом этапе воспитанник может с субботы на воскресение ночевать дома. Это способствует более лёгкой адаптации подростка к самостоятельной жизни вне Центра с полученным новым опытом и моделями поведения.